Ну как ответить на Ваш вопрос?
Останавливается двигатель или камера дробления?Через одинаковые промежутки времени останавливается? Не совпадают ли они (промежутки) с уставками контроллера двигателя по отключению из-за низкого уровня антифриза или неработающего генератора?

Как Вы смотрели шину передачи данных? Какое сопротивление в замкнутой цепи CAN-шины и в разомкнутых ветвях? Должно быть около 60 Ом на замкнутой цепи и по 120 Ом в каждой из разомкнутых ветвей. На контроллере двигателя терминальное сопротивление может стоять в самом штекере, поэтому между пинами контроллера сопротивление будет другое.
В каких пределах напряжение на них?
Звонятся ли провода между собой или на землю?
Похоже на проблему в кабеле, который соединяет контроллер дробилки и контроллер двигателя. На осцилографе, как мне кажется, Вы увидите наличие запросов (изменение напряжения в цепи), но не ответов на запросы.